安全認證優質企業之進出口貨物享有最低的文件審查及貨物抽驗比率,海關得設立貨物未放行案件處理單一窗口,提供廠商查詢並協助解決通關流程問題,並得申請使用非侵入方式查驗貨物,另出口報單離岸價格或進口報單完稅價格為新台幣1億元以上者,得以免審免驗通關。與其他國家簽署AEO 相互承認協議,促使在我國獲得優質企業認證之業者,在完成相互承認之其他國家亦可比照該國AEO享有同等優惠。獲得安全認證優質企業,將可提升在國際貿易供應鏈中拓展業務、貿易夥伴合作機會,同時獲得客戶認可與企業自身競爭力。